前面说过，国内几乎所有做胃镜的人，如果检查没有发现异常，都会被诊断为“慢性胃炎”，详情请参见《你不是胃炎》。但和胃镜不同的是，多数做结肠镜检查而没有异常者，却不会被诊断为“慢性结肠炎”。主要原因是慢性结肠炎不是一个正规的医学术语，看一下教科书就知道了，一般教科书都有“慢性胃炎”这一节，但没有“慢性结肠炎”这一节。结肠镜普及之初的时候，确实有下“慢性结肠炎”诊断的结肠镜报告，但随之而来的问题是，下了诊断该怎么治疗？
一般老百姓被诊断为“炎”，第一反应就是该“消炎”。所谓的“消炎药”十有八九有都是抗生素。结肠炎和慢性胃炎不同，一般的慢性胃炎，除非是明确有幽门螺杆菌感染，都不需要使用抗生素。因为慢性胃炎的症状多有物理和化学刺激有关。但结肠炎就不一样了，病因主要是感染和免疫两大类。有的教科书分别将两种病因的结肠炎称为“特异性结肠炎”和“非特异性结肠炎”。所谓特异性，就是由特异性的病原体引起，比如细菌引起的叫做“慢性菌痢”，由阿米巴引起的叫“肠阿米巴病”。要诊断特异性结肠炎，往往需要相应的接触史和实验室检查证据。比如吃了不干净的东西，在传染病流行地区居住，大便培养发现细菌等等。诊断之后治疗就是用针对相应病原体的药物。
因为卫生环境和生活水平的改善，感染导致的特异性结肠炎已经很少见了。越来越多的是找不到感染依据的“非特异性结肠炎”，主要包括两种：溃疡性结肠炎和克罗恩病，统称为“炎症性肠病”。尤其是前者占主要，后者很少见但不罕见。这两种疾病的原因主要认为与免疫有关。和其他很多自身免疫性疾病一样，病人自己的免疫系统没有很好的区分哪些该杀哪些不该杀，或者动不动小题大做，本该睁一只眼闭一只眼的地方却弄得鸡飞狗跳。基于这样的发病机制，所以对这样疾病的治疗主要是抑制全身或局部的免疫反应。
不管是抗生素还是免疫抑制剂，都存在一定的副作用，有些是可逆的，但听起来比较吓人，比如治疗炎症性肠病的柳氮磺胺吡啶，说明书上写着可能导致一过性的不育。但如果不治疗，炎症继续发展，局部的溃疡糜烂就可能发展成全结肠的溃疡，出血，发热。严重的会出现中毒性巨结肠，危及生命。抗生素长期应用会导致伪膜性肠炎。所以，如果要用药，必须要有一个明确的诊断。诊断不明确，宁可继续观察，也不要给一个模棱两可的“慢性肠炎”诊断。
